Aplicación de PCR a partir de cultivo en la identificación de subespecies del complejo Mycobacterium Tuberculosis / The use of culture-based PCR for the identification of subspecies of the mycobacterium tuberculosis complex

Los métodos diagnósticos clásicos de tuberculosis (TB) se basan en la utilización de baciloscopía y cultivo. La identificación del agente etiológico desde la positivización del cultivo requiere entre 10 y 15 días, mientras que el empleo de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) disminuye el tiempo a 24 h, lo que permite no solo identificar las subespecies del complejo Mycobacterium tuberculosis (CMTB) sino también diferenciarlas de otras especies ambientales clínicamente importantes (MOTT) facilitando el diagnóstico y tratamiento. El objetivo del presente trabajo fue determinar la utilidad de la PCR en la identificación temprana de las micobacterias pertenecientes al CMTB, a partir de cultivos positivos, de pacientes con sospecha de TB, atendidos en un hospital pediátrico de alta complejidad, durante un período de cuatro años. A cada muestra, se le realizó baciloscopía y cultivo en medio líquido. A los cultivos positivos, una inmunocromatografía lateral (TBIDR) y luego PCR. El 4,6% del total de muestras (510/11.162) pertenecientes a 198 pacientes presentó cultivos positivos. Cuatrocientos veintiseis (84%) correspondieron a muestras respiratorias. El rendimiento de la baciloscopía directa fue del 41% (194/470). Cuatrocientos treinta y ocho (86%) resultaron M. tuberculosis, 21 (4%) Mycobacterium bovis, 7 (1%), M. bovis-BCG y 44 (9%) MOTT. La utilización de medios de cultivos líquidos junto con el empleo de PCR favorecen una rápida orientación microbiológica y constituye una estrategia útil para optimizar el manejo clínico de estas infecciones, desde el punto de vista terapéutico y epidemiológico, especialmente en pediatría (AU)

Classical diagnostic methods for tuberculosis (TB) are based on the use of smear microscopy and culture. The identification of the etiological agent from positive culture requires 10 to 15 days, while the use of the polymerase chain reaction (PCR) reduces the time to 24 h, which allows not only to identify the subspecies of the Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) but also to differentiate them from clinically important environmental mycobacteria other than tuberculosis (MOTT), facilitating diagnosis and treatment. The aim of this study was to determine the usefulness of PCR in the early identification of mycobacteria belonging to the MTC, from positive cultures of patients with suspected TB seen in a pediatric tertiary hospital over a 4-year period. For each sample, smear microscopy and culture in liquid medium was performed. Positive cultures were subjected to lateral immunochromatography (TBIDR) and then PCR. Of the total number of samples (510/11,162) belonging to 198 patients, 4.6% showed positive cultures; 426 (84%) were respiratory samples. The direct smear microscopy yield was 41% (194/470). Overall, 438 (86%) were found to be M. tuberculosis, 21 (4%) Mycobacterium bovis, 7 (1%), M. bovis-BCG, and 44 (9%) MOTT. The use of liquid culture media together with the use of PCR favors a rapid microbiological orientation and is a useful strategy to optimize the clinical management of these infections, from a therapeutic and epidemiological point of view, especially in children (AU)

Ocorrência de Babesia sp, Ehrlichia canis e Hepatozoon canis em cães domiciliados, em dois municípios do estado do Espírito Santo - Brasil / Occurrence of Babesia sp, Ehrlichia canis and Hepatozoon canis in domiciled dogs in two municipalities of the state of Espírito Santo - Brazil / Ocurrencia de Babesia sp, Ehrlichia canis y Hepatozoon canis em perros domiciliados em dos municipios del estado de Espírito Santo - Brasil

As doenças transmitidas por carrapatos são afecções de grande importância na clínica médica de pequenos animais, devido à alta casuística e ampla distribuição vetorial no território brasileiro. Os principais agentes responsáveis pelas infecções em cães são Babesia sp., Ehrlichia canis e Hepatozoon canis. Os animais infectados são assintomáticos ou apresentam sinais clínicos inespecíficos, sendo necessário a utilização de testes diagnósticos para definição do agente etiológico, e diagnóstico seguro. O objetivo do presente estudo foi determinar a ocorrência desses micro-organismos em cães naturalmente infectados, domiciliados nos municípios de Vila Velha e Anchieta, Espírito Santo, utilizando diferentes testes de detecção: Reação em cadeia polimerase (PCR), sorologia para detecção de anticorpos anti Ehrlichia canis e pesquisa de hematozoários em esfregaço sanguíneo. Foram analisadas 65 amostras de sangue obtidas por venopunção de veia cefálica de cães. No teste de PCR, 4,62% dos animais foram positivos para Babesia vogeli e 1,54% para Ehrlichia canis sendo os resultados para Hepatozoon canis negativos. No teste sorológico para E. canis 90,77% dos animais foram positivos para a presença de anticorpos, e na pesquisa em lâminas de esfregaço sanguíneo 3,02% apresentavam outros hemoparasitas. Os resultados indicam a dispersão desses hemoparasitas na população canina da região de estudo, entretanto com baixa ocorrência. O teste de PCR demonstrou-se como o mais sensível no qual Babesia vogeli foi o agente mais observado.(AU)

Tick-borne diseases are diseases of great importance in the medical practice of small animals, due to the high casuistry and wide vectorial distribution in the Brazilian territory. The main agents responsible for infections in dogs are Babesia sp., Ehrlichia canis and Hepatozoon canis. Infected animals are asymptomatic or present nonspecific clinical signs, requiring the use of diagnostic tests to define the etiologic agent, and safe diagnosis. The objective of the present study was to determine the occurrence of these microorganisms in naturally infected dogs domiciled in the municipalities of Vila Velha and Anchieta, Espírito Santo, using different detection tests: polymerase chain reaction (PCR), serology to detect antibodies against Ehrlichia canis and research of hematozoa in blood smears. Sixty-five blood samples obtained by venipuncture of the cephalic vein of dogs were analyzed. In the PCR test, 4.62% of the animals were positive for Babesia vogeli and 1.54% for Ehrlichia canis, and the results for Hepatozoon canis were negative. In the serological test for E. canis, 90.77% of the animals were positive for the presence of antibodies, and in the research in blood smear slides, 3.02% presented other hemoparasites. The results indicate the dispersion of these hemoparasites in the canine population of the study region, however with low occurrence. The PCR test proved to be the most sensitive, in which Babesia vogeli was the most observed agent.(AU)

Las enfermedades transmitidas por garrapatas son enfermedades de gran importancia en la práctica médica de los pequeños animales, debido a la alta casuística y amplia distribución vectorial en el territorio brasileño. Los principales agentes responsables de las infecciones en los perros son Babesia sp., Ehrlichia canis y Hepatozoon canis. Los animales infectados son asintomáticos o presentan signos clínicos inespecíficos, siendo necesario el uso de pruebas diagnósticas para la definición del agente etiológico, y el diagnóstico seguro. El objetivo del presente estudio fue determinar la ocurrencia de estos microorganismos en perros infectados naturalmente, domiciliados en los municipios de Vila Velha y Anchieta, Espírito Santo, utilizando diferentes pruebas de detección: reacción en cadena de la polimerasa (PCR), serología para detectar anticuerpos anti Ehrlichia canis e investigación de hematozoos en frotis de sangre. Se analizaron sesenta y cinco muestras de sangre obtenidas por venopunción de la vena cefálica de los perros. En la prueba PCR, el 4,62% de los animales fueron positivos para Babesia vogeli y el 1,54% para Ehrlichia canis, y los resultados para Hepatozoon canis fueron negativos. En la prueba serológica para E. canis, el 90,77% de los animales fueron positivos a la presencia de anticuerpos, y en la investigación en láminas de frotis de sangre el 3,02% presentaron otros hemoparásitos. Los resultados indican la dispersión de estos hemoparásitos en la población canina de la región de estudio, aunque con una baja presencia. La prueba PCR resultó ser la más sensible, en la que Babesia vogeli fue el agente más observado.(AU)

Effect of Leptin, Pituitary Transcription Factor and Luteinizing Hormone Receptor Genes Polymorphisms on Reproductive Traits and Milk Yield in Holstein Cattle

Abstract The aim of this study was to estimate allelic and genotypic frequencies of markers in the leptin (LEP), pituitary transcription factor (PIT-1) and luteinizing hormone receptor (LHR) genes and evaluate their effects on reproductive traits and milk yield of Holstein cattle. Data from 147 cows from department of Francisco Morazán, Honduras, were collected and PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) assays were performed to characterize the PIT-1-HinfI, LEP- A59V and LHR-rs41256848 polymorphisms. To estimate the effect of genotypes on reproductive traits and milk yield fixed and mixed linear models were fitted. The frequencies of the genotypes CC, CT and TT of A59V, AA, AB and BB of HinfI, and CC, CG and GG of rs41256848 were 0.46, 0.33 and, 0.21; 0.09, 0.32 and 0.58; and 0.37, 0.61 and 0.02, respectively. The genotypes of LEP and LHR showed deviations from Hardy-Weinberg equilibrium. The A59V polymorphism was significantly associated with the calving to conception interval (CCI) (p=0.01), being the C allele favorable. The HinfI and rs41256848 polymorphism were significantly associated (p=0.08 and p=0.04) with age to first calving (AFC), being the A and G the alleles favorable associated, respectively. The results suggest that LEP, PIT and LHR polymorphisms can probably act as candidate to be used in marker-assisted selection for AFC and CCI traits.

Active human herpesvirus infections in adults with systemic lupus erythematosus and correlation with the SLEDAI score

Abstract Background: Human herpesviruses (HHVs) are responsible for a significant number of clinical manifestations in systemic lupus erythematous (SLE) patients. The aim of this study was to determine the frequency of active HHV infections in SLE patients and correlating them with disease activity. Methods: Serum samples were collected from 71 SLE patients and their DNAs were extracted and analyzed to detect HHV-DNA viruses using the nucleic acid amplification technique. Results: Fifteen out of the 71 (21.1%) patients tested positive for the HHV-DNA virus. Of them, 11/15 HHV-DNA-positive patients (73.3%) had SLE activity index (SLEDAI - Systemic Lupus Erythematosus Disease Activity Index) ≥8 (p = 0.0001). Active HCMV infection was the mostly frequently observed infection, occurring in 6/15 patients (40%). The frequencies of other active viral infections were 22% for HSV-1, 16.7% for HHV-7, and 5.5% for HSV-2. Viral coinfection (two or more viruses detected in the same sample) occurred in three patients (16.7%). Active HHV infections in SLE patients are more frequent in those with active SLE (≥8), who is at high risk of HHV reactivation and HCMV disease. Conclusion: Viral surveillance is important to identify active HHV infections that can cause clinical symptoms and other complication in SLE patients.

Catharanthus roseus (Apocynaceae) naturally infected with diverse phytoplasmas in Costa Rica / Catharanthus roseus (Apocynaceae) naturalmente infectada con diversos fitoplasmas en Costa Rica

Abstract Phytoplasmas (class Mollicutes) are causal agents of plant diseases with an economic impact on crops or threatening local biodiversity. A survey was conducted from 2012 to 2016 on infected Catharanthus roseus plants that exhibited symptoms reminiscent of phytoplasma infection throughout Costa Rica. A total of 73 plants were collected exhibiting symptoms such as virescence, phyllody, axillary proliferation, little leaf, leaf malformation, chlorosis, or yellowing. All samples were tested by nested PCR using phytoplasma universal and specific primer pairs. Phytoplasma infection was detected in 52 (71.2 %) of the plants collected. Phytoplasmas of six subgroups belonging to 16Sr groups I, III, IX, XIII and XV were identified based on sequencing and in silico RFLP analyses. 'Candidatus Phytoplasma asteris' (16SrI) was the predominant group among the positive samples (n = 30) showing variety of symptoms and wide distribution from sea level to ca. 1 400 m.a.s.l. in six of the seven Costa Rican provinces. Group 16SrIII was the second most abundant (14 samples); and the remaining three groups were seldom found in C. roseus (8 samples). Moreover, group 16SrXIII phytoplasma was detected for the first time in the country. To the best of our knowledge, this is the first report of natural infection of C. roseus with phytoplasma subgroups 16SrI-B, 16SrI-P, 16SrIII-F, 16SrIX-F, 16SrXIII-A, and 16SrXV-B in Costa Rica and Central America.

Resumen Los fitoplasmas (clase Mollicutes) son agentes causales de enfermedades de plantas que provocan pérdidas económicas o amenazan la biodiversidad local. Una recolecta de plantas de Catharanthus roseus que mostraban síntomas de posible infección con fitoplasmas se realizó en diferentes lugares de Costa Rica desde 2012 a 2016. Un total de 73 plantas fueron recolectadas con síntomas tales como viriscencia, filodia, brotación axilar múltiple, reducción foliar, deformación foliar, clorosis, y amarillamiento. Todas las muestras fueron evaluadas mediante PCR anidado usando los pares de imprimadores universales y específicos para fitoplasmas. Infección por fitoplasmas se detectó en 52 (71.2 %) de las muestras. Fitoplasmas de seis subgrupos dentro de los grupos 16Sr I, III, IX, XIII y XV fueron identificados basados en secuenciación del ADN y análisis de polimorfismos de restricción (RFLP) in silico. El grupo predominante encontrado en las muestras positivas (n = 30) fue el 16SrI ('CandidatusPhytoplasma asteris'), éste mostró variedad de síntomas y amplia distribución desde el nivel del mar hasta casi los 1 400 m.s.n.m. en seis de las siete provincias de Costa Rica. El grupo 16SrIII fue el segundo más abundante (14 muestras); y los restantes tres grupos se encontraron en pocas muestras de C. roseus (8 muestras). Además, fitoplasmas del grupo 16SrXIII se detectaron por primera vez en el país. De acuerdo a nuestro conocimiento, este es el primer informe de infección natural de C. roseus con fitoplasmas de los subgrupos 16SrI-B, 16SrI-P, 16SrIII-F, 16SrIX-F, 16SrXIII-A y 16SrXV-B en Costa Rica y Centroamérica.

Functional status and severity of osteoarthritis in elderly is associated to the polymorphism of TNFA gene

Abstract Background: Osteoarthritis (OA) is a major musculoskeletal disease with high prevalence in the elderly. The study of genetic polymorphisms of inflammatory mediators involved in OA may contribute to the elucidation of the complex pathophysiology of this disease and identification of susceptibility individuals. Aim: This study aimed to evaluate the association between polymorphism at tumor necrosis factor alpha gene (SNP - 308 G/A TNFA) with presence, severity and functional status of osteoarthritis in elderly. Methods: This study was characterized as case-control and encompassed 257 physically independent elderly (Mean Age: 68.55 ± 5.2; Minimum age: 60 and Maximum age: 82) were recruited. After this selection, the groups were divided in: 92 elderly individuals with osteoarthritis (case group) and 165 without the disease (control group). Methods: The individuals were genotyped by the TaqMan real-time PCR system. The subjects were classified based on the degree of radiological impairment according to the criteria of Kellgren-Laurence and regarding functional impairment using the WOMAC and LEQUESNE questionnaires. Results: TNFA gene polymorphic individuals (subjects harboring allele A) are more affected by OA (χ2 = 8.7, p = 0.003), once they have major radiological lesion both in hip (Fisher-Freeman-Halton Test = 3.9, p = 0.04) and knee (Fisher- Freeman-Halton Test = 4.0, p = 0.04) as well as worse functional status assessed by the Lequesne questionnaire (Mann- Whitney, p = 0.04). At the multivariate analysis, after adjustment for age, gender, body mass index, the presence of rare allele for TNFA (allele A) increases the susceptibility to OA development [OR: 1.87 (95% CI: 1.1 —3.2)]. Conclusion: We conclude that the SNP - 308 G/A of TNFA gene may affect osteoarthritis susceptibility, severity and functional status of individuals with osteoarthritis.

Cloning and high-level expression of Thermus thermophilus RecA in E. coli: purification and novel use in HBV diagnostics

ABSTRACT We studied the role of Thermus thermophilus Recombinase A (RecA) in enhancing the PCR signals of DNA viruses such as Hepatitis B virus (HBV). The RecA gene of a thermophilic eubacterial strain, T. thermophilus, was cloned and hyperexpressed in Escherichia coli. The recombinant RecA protein was purified using a single heat treatment step without the use of any chromatography steps, and the purified protein (>95%) was found to be active. The purified RecA could enhance the polymerase chain reaction (PCR) signals of HBV and improve the detection limit of the HBV diagnosis by real time PCR. The yield of recombinant RecA was ∼35 mg/L, the highest yield reported for a recombinant RecA to date. RecA can be successfully employed to enhance detection sensitivity for the diagnosis of DNA viruses such as HBV, and this methodology could be particularly useful for clinical samples with HBV viral loads of less than 10 IU/mL, which is interesting and novel.

Brotes de enfermedades transmitidas por los alimentos estudiados mediante técnicas moleculares / Foodborne disease outbreaks studied by molecular techniques

RESUMEN Objetivo Aplicar una técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) múltiple en tiempo real para la detección de Salmonella spp., Listeria monocytogenes y Yersinia enterocolitica, como herramienta de apoyo diagnóstico en la vigilancia de brotes de enfermedad transmitida por alimentos. Materiales y Métodos Se aplicó la metodología molecular en muestras clínicas provenientes de individuos que estaban asociados a brotes de enfermedad transmitida por alimentos de dos departamentos de Colombia. Los resultados se compararon con los datos arrojados por la metodología convencional de cultivo. Adicionalmente a los aislamientos obtenidos se les evaluó relación clonal mediante la técnica de electroforesis de campo pulsado (PFGE). Resultados Se determinó un total de 123 casos de enfermedad transmitida por alimentos de los cuales 45 muestras biológicas fueron confirmadas por laboratorio y 88 mediante nexo epidemiológico. La metodología molecular detectó 35/45 muestras positivas frente a 17/45 muestras positivas detectadas mediante la metodología convencional. La PFGE demostró relación clonal en cada brote. Conclusión Los resultados del estudio demuestran la aplicabilidad de la técnica molecular como herramienta útil de apoyo diagnóstico en la caracterización de brotes de enfermedad transmitida por alimentos, permitiendo una respuesta oportuna y confiable.(AU)

ABSTRACT Objective To apply a multiplex real-time polymerase chain reaction (PCR) technique to detect Salmonella spp., Listeria monocytogenes, and Yersinia enterocolitica as a diagnostic support tool for the surveillance of foodborne disease outbreaks. Materials and Methods Molecular methodology was applied on clinical samples taken from individuals who were associated with foodborne disease outbreaks in two departments of Colombia. The results were compared with the data obtained by conventional culture methodology. In addition, the clonal relation of the isolations was evaluated using the Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) technique. Results 123 cases of foodborne disease were determined, of which 45 biological samples were confirmed by laboratory and 88 by epidemiological link. The molecular methodology detected 35/45 positive samples versus 17/45 positive samples detected by conventional methodology. PFGE demonstrated a clonal relation during each outbreak. Conclusion The results of the study demonstrate the applicability of the molecular technique as a useful diagnostic support tool to characterize foodborne disease outbreaks, allowing a timely and reliable response.(AU)

Abordaje diagnostico terapéutico de la neumonía viral grave / Diagnostic therapeutic approach to severe viral pneumonia

La guía de referencia rápida tiene como objetivo proporcionar al usuario las recomendaciones clave de la guía. Abordaje diagnóstico y terapéutico de la neumonía viral grave, seleccionadas con base a su impacto en salud por el grupo desarrollador, las cuales pueden variar en función de la intervención de que se trate, así como del contexto regional o local en el ámbito de su aplicación.

Analysis of the presence of FLT3 gene mutation and association with prognostic factors in adult and pediatric acute leukemia patients

ABSTRACT When the FLT3 gene is mutated, it originates a modified receptor with structural changes, which give survival advantage and malignant hematopoietic cell proliferation. Thus, the presence of mutations in this gene is considered an unfavorable prognostic factor. A total of 85 consecutive samples of newly diagnosed untreated patients with AL were included in the study after they provided their informed consent. FLT3 gene mutations were detected by PCR. For the pediatric group, a positive correlation was observed between WBC count and the presence of FLT3-ITD in patients with AML and ALL. Furthermore, children with AML who had the FLT3-ITD mutation showed a tendency to express CD34 in blast cells. In the adult group, the AML patients with FLT3-ITD who expressed CD34 in blast cells had a tendency to worse progression. The present data indicate no association between the prognostic factors evaluated and FLT3 gene mutations in adult with AL. Yet, the presence of FLT3-ITD mutation was significantly related with WBC count in the pediatric group. These findings demonstrate that FLT3 gene mutations can be considered as independent poor prognostic factors.

Prolonged Zika virus viremia in a patient with Guillain-Barré syndrome in Trinidad and Tobago / Viremia prolongada por el virus del Zika en un paciente con síndrome de Guillain-Barré en Trinidad y Tabago / Viremia prolongada do vírus zika em paciente com síndrome de Guillain-Barré em Trinidad e Tobago

ABSTRACT An emerging mosquito-borne flavivirus, Zika virus (ZIKV) is a significant public health concern because of the syndromes associated with the infection. In addition, ZIKV is considered a major problem due to large-scale spread of the disease and the possible clinical complications for the central nervous system, especially Guillain-Barré syndrome (GBS) and microcephaly. Since the introduction of ZIKV in the Caribbean, molecular detection of the viral RNA has been utilized as a more specific and sensitive approach to demonstrating acute infection. However, it is generally accepted that the virus has a short viremic period, generally less than 5 days. Serologic testing has the inconvenience of strong cross-reactivity among flaviviruses, such as dengue and yellow fever. As part of the laboratory surveillance activities for Zika and other arboviruses at the Caribbean Public Health Agency, in 2016 a sample from a male who was clinically diagnosed with GBS tested positive for Zika virus by real-time polymerase chain reaction (rRT-PCR). The serum sample had been taken on day 21 after the onset of symptoms. The case had initially been characterized as a typical ZIKV infection (mild fever with a generalized maculopapular rash). Later, weakness of limbs and other peripheral neurological symptoms appeared. Enzyme-linked immunoassay (ELISA) showed that the sample was negative for IgM antibodies against Zika, Chikungunya, and dengue viruses. The plaque reduction neutralization test was positive for ZIKV. This indicated parallel development of viremia and immune response against ZIKV. Recent reports have demonstrated a longer duration of the viremia in ZIKV infections. However, our report is the first one that links the infection with extended viremia and the development in parallel of a GBS case.(AU)

RESUMEN El virus del Zika (ZIKV), un flavivirus emergente transmitido por mosquitos, es una inquietud importante en el ámbito de la salud pública por los síndromes asociados con la infección. Además, el ZIKV se considera un problema acuciante debido a la propagación a gran escala de la enfermedad y a las posibles complicaciones clínicas en el sistema nervioso central, en concreto, el síndrome de Guillain-Barré y la microcefalia. Desde que el ZIKV se introdujera en el Caribe, la detección molecular del ARN viral ha sido el método más específico y sensible utilizado para comprobar una infección aguda. Sin embargo, se cree que el virus tiene un período virémico corto, de menos de 5 días en general. La prueba serológica presenta el inconveniente de la fuerte reactividad cruzada entre los flavivirus, como el dengue y la fiebre amarilla. Como parte de las actividades de vigilancia de laboratorio para el Zika y otros arbovirus del Agencia Caribena de Salud Publica, en el 2016 la muestra de un hombre diagnosticado con la enfermedad de Guillain Barré dio positiva para el virus del Zika por medio de una reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (rRT-RCP). La muestra de suero se había tomado en el día 21 después de la aparición de los síntomas. En un principio, el caso se calificó como una infección por ZIKV típica (fiebre leve con una erupción maculopapular generalizada). Posteriormente, apareció la debilidad de los miembros y otros síntomas neurológicos periféricos. La prueba de inmunoadsorción enzimática (ELISA) fue negativa para los anticuerpos de tipo IgM contra los virus del Zika, el chikunguña y el dengue. La prueba de neutralización por reducción del número de placas dio positivo para el ZIKV, lo que probó que paralelamente se había desarrollado una respuesta virémica e inmune contra el ZIKV. En informes recientes se ha demostrado que en las infecciones de ZIKV el periodo virémico es más largo. Sin embargo, nuestro informe es de los primeros que relaciona un periodo virémico prolongado con el desarrollo paralelo del síndrome de Guillain-Barré.(AU)

RESUMO O vírus zika é um flavivírus emergente transmitido por mosquitos e tem sido motivo de grande preocupação em saúde pública por causa das síndromes associadas à infecção. É também considerado um importante problema devido à propagação em grande escala e possíveis complicações clínicas no sistema nervoso central decorrentes da infecção, sobretudo síndrome de Guillain-Barré e microcefalia. Desde a introdução do vírus zika no Caribe, a detecção molecular do RNA viral tem sido usada como método mais específico e sensível para demonstrar infecção aguda. Porém, admite-se em geral que o vírus tem um curto período virêmico, inferior a 5 dias. O teste sorológico tem o inconveniente de produzir intensa reação cruzada com outros flavivírus, como os vírus da dengue e febre amarela. Como parte da vigilância laboratorial do vírus zika e outros arbovírus pela Agência de Saúde Pública do Caribe, em 2016, foi examinada uma amostra de um paciente do sexo masculino com diagnóstico clínico de síndrome de Guillain-Barré e o resultado foi positivo para o vírus zika com a técnica de reação em cadeia da polimerase em tempo real. A amostra sérica havia sido coletada no dia 21 após o início dos sintomas. O caso foi inicialmente descrito como infecção típica pelo vírus zika (febre baixa com erupção cutânea maculopapular generalizada) e, posteriormente, o paciente apresentou fraqueza dos membros e outros sintomas neurológicos periféricos. A amostra foi testada com a técnica de imunoensaio enzimático (ELISA) e foi negativa para anticorpos da classe IgM contra o zika vírus, vírus chikungunya e vírus da dengue. O teste de neutralização por redução de placas foi positivo para o vírus zika, indicando aumento em paralelo da viremia e resposta imunológica ao vírus. Informes recentes têm demonstrado viremia de duração mais prolongada em infecções por vírus zika. Porém, este é o primeiro relato que associa a infecção com viremia prolongada ao surgimento em paralelo da síndrome de Guillain-Barré.(AU)

Importance of the association of molecular and immunological diagnosis in immunocompetent patient with Histoplasma capsulatum and Cryptoccocus neoformans infection: a case report

This case reports an immunocompetent 29-year-old woman with suspected pneumonia, suggestive of fungal infection. Immunoblotting analysis reactivity against Histoplasma capsulatum and Paracoccidioides brasiliensis were observed. Nested-PCR in blood employing species-specific primers was positive for H. capsulatum and Cryptococcus neoformans. The evaluation of paucisymptomatic patients with positive results for H. capsulatum and C. neoformans could be relevant for the prevention as well as the possible evaluation of the reactivated quiescent foci. In conclusion, the associated methodology may have contributed to the monitoring endogenous reactivation of these diseases.

Desenvolvimento de um protocolo de PCR em Tempo Real para diagnóstico de malária subpatente e infecções mistas por Plasmodium Vivax e Plasmodium falciparum

O diagnóstico adequado de malária permanece como um dos pilares dos programas de controle da doença no mundo, já que um diagnóstico eficiente permite a identificação precoce de casos e definição do esquema terapêutico, contribuindo para interrupção do ciclo biológico do parasito. A microscopia óptica (MO), atual diagnóstico de referência para malária, tem apresentado limitações, principalmente em casos de co-infecções e baixas parasitemias. Assim sendo, busca-se por técnicas mais sensíveis e específicas para auxiliar a MO, sendo os métodos baseados na reação em cadeia da polimerase (PCR) considerados mais adequados para identificação de indivíduos com infecção submicroscópica. Entretanto, os vários protocolos de PCR apresentados até o momento tem se baseado no gene da subunidade menor do RNA ribossomal 18S dos plasmódios (18S rRNA), que se encontra em poucas cópias no genoma destes parasitos. Recentemente, foram descritas sequências não ribossomais para identificação de Plasmodium vivax(Pvr47) e Plasmodium falciparum (Pfr364), sendo estas sequências promissoras para o diagnóstico molecular de malária. Baseando-se nestes achados, este trabalho propôs o desenvolvimento de um protocolo de Real-Time PCR para validar os alvos Pvr47 e Pfr364 para o diagnóstico de malária vivax e falciparum,respectivamente, com ênfase em infecções mistas e baixas parasitemias. Após padronização com sucesso da técnica de Real-Time PCR (RT-LAMAL), a mesma foi comparada a três outros protocolos moleculares, sendo duas técnicas baseadas no gene 18S rRNA – Nested-PCR (Snounou et al., 1993) e Real-Time PCR (Mangold etal., 2005) – e uma PCR convencional baseada nos alvos Pvr47/Pfr364 (Demas etal., 2011).

Para avaliar os protocolos quanto aos seus limites de detecção de infecções únicas e mistas por P. vivax e P. falciparum, foram realizadas titulações de misturas artificiais com diferentes concentrações dos parasitos. Os resultados obtidos nesta etapa revelaram que a PCR-Demas e RT-LAMAL apresentaram os menores limites de detecção para P. vivax e P. falciparum, tanto em infecções únicas quanto mistas, e que o protocolo de RT-Mangold foi incapaz de detectar coinfecções.Posteriormente, os protocolos foram avaliados para o diagnóstico de malária em amostras de campo, incluindo área não endêmica (n=117) e área endêmica para malária (n=163). Os resultados revelaram que os protocolos de RT-Mangold,PCR-Demas e RT-LAMAL foram mais eficientes na detecção de parasitemias submicroscópicas, porém, o protocolo de RT-Mangold novamente mostrou ser incapaz de detectar infecções mistas. Em conjunto, os dados obtidos demonstraram que os alvos Pvr47/Pfr364 foram mais adequados para o diagnóstico molecular de malária vivax e falciparum do que o gene 18S rRNA. Contudo, o protocolo aqui desenvolvido (RT-LAMAL) se mostra em vantagem à PCR-Demas,com maior rapidez na obtenção de resultados, dispensando a revelação em gel deagarose e uso de brometo de etídeo, além de diminuir a possibilidade de contaminação de reagentes e amostras. Portanto, conclui-se que a RT-LAMAL possui grande potencial para o diagnóstico molecular de certeza de pacientes com infecções mistas e baixas parasitemias.

Desenvolvimento de um protocolo de PCR em Tempo Real para diagnóstico de malária subpatente e infecções mistas por Plasmodium Vivax e Plasmodium falciparum / Development of a PCR protocol Real time to diagnosis of malaria and subpatent mixed infections with Plasmodium Vivax and Plasmodium falciparum

O diagnóstico adequado de malária permanece como um dos pilares dos programas de controle da doença no mundo, já que um diagnóstico eficiente permite a identificação precoce de casos e definição do esquema terapêutico, contribuindo para interrupção do ciclo biológico do parasito. A microscopia óptica (MO), atual diagnóstico de referência para malária, tem apresentado limitações, principalmente em casos de co-infecções e baixas parasitemias. Assim sendo, busca-se por técnicas mais sensíveis e específicas para auxiliar a MO, sendo os métodos baseados na reação em cadeia da polimerase (PCR) considerados mais adequados para identificação de indivíduos com infecção submicroscópica. Entretanto, os vários protocolos de PCR apresentados até o momento tem se baseado no gene da subunidade menor do RNA ribossomal 18S dos plasmódios (18S rRNA), que se encontra em poucas cópias no genoma destes parasitos. Recentemente, foram descritas sequências não ribossomais para identificação de Plasmodium vivax(Pvr47) e Plasmodium falciparum (Pfr364), sendo estas sequências promissoras para o diagnóstico molecular de malária. Baseando-se nestes achados, este trabalho propôs o desenvolvimento de um protocolo de Real-Time PCR para validar os alvos Pvr47 e Pfr364 para o diagnóstico de malária vivax e falciparum,respectivamente, com ênfase em infecções mistas e baixas parasitemias. Após padronização com sucesso da técnica de Real-Time PCR (RT-LAMAL), a mesma foi comparada a três outros protocolos moleculares, sendo duas técnicas baseadas no gene 18S rRNA – Nested-PCR (Snounou et al., 1993) e Real-Time PCR (Mangold etal., 2005) – e uma PCR convencional baseada nos alvos Pvr47/Pfr364 (Demas etal., 2011)...

Para avaliar os protocolos quanto aos seus limites de detecção de infecções únicas e mistas por P. vivax e P. falciparum, foram realizadas titulações de misturas artificiais com diferentes concentrações dos parasitos. Os resultados obtidos nesta etapa revelaram que a PCR-Demas e RT-LAMAL apresentaram os menores limites de detecção para P. vivax e P. falciparum, tanto em infecções únicas quanto mistas, e que o protocolo de RT-Mangold foi incapaz de detectar coinfecções.Posteriormente, os protocolos foram avaliados para o diagnóstico de malária em amostras de campo, incluindo área não endêmica (n=117) e área endêmica para malária (n=163). Os resultados revelaram que os protocolos de RT-Mangold,PCR-Demas e RT-LAMAL foram mais eficientes na detecção de parasitemias submicroscópicas, porém, o protocolo de RT-Mangold novamente mostrou ser incapaz de detectar infecções mistas. Em conjunto, os dados obtidos demonstraram que os alvos Pvr47/Pfr364 foram mais adequados para o diagnóstico molecular de malária vivax e falciparum do que o gene 18S rRNA. Contudo, o protocolo aqui desenvolvido (RT-LAMAL) se mostra em vantagem à PCR-Demas,com maior rapidez na obtenção de resultados, dispensando a revelação em gel deagarose e uso de brometo de etídeo, além de diminuir a possibilidade de contaminação de reagentes e amostras. Portanto, conclui-se que a RT-LAMAL possui grande potencial para o diagnóstico molecular de certeza de pacientes com infecções mistas e baixas parasitemias...

Importancia del diagnóstico molecular en la tuberculosis extrapulmonar / The importance of molecular diagnosis in extrapulmonary tuberculosis

Introducción: La tuberculosis extrapulmonar (TBEP) representa un gran problema diagnóstico, ya que la tinción de Ziehl-Neelsen (ZN) y el cultivo son útiles, pero no pueden detectar un importante número de casos debido a que son poco bacilíferos (paucibacilares). Objetivo: Determinar la utilidad de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) anidada en el diagnóstico de la enfermedad. Material y métodos: De septiembre 2002 a febrero 2008 se estudiaron 469 pacientes con sospecha de TBEP. Se consideró el perfil clínico de los pacientes y se tomaron las muestras biológicas correspondientes. Después de que se procesaron las tinciones de ZN y los cultivos en Lowenstein-Jensen (LJ), se extrajo el DNA y se hizo la PCR anidada. Al final se compararon los resultados de todas las pruebas. Resultados: Se confirmaron 183 pacientes con TBEP, en base a parámetros de laboratorio (ZN, cultivo, PCR positiva), imagenología y respuesta clínica al tratamiento. Conclusión: La PCR puede considerarse como una herramienta valiosa para el diagnóstico de TBEP, a la par con ZN, cultivo, imagenología y respuesta al tratamiento.

Evolução de parâmetros clínicos e da carga parasitária em sangue periférico de crianças hospitalizadas por leishmaniose visceral

No Brasil, observa-se aumento dos casos de leishmaniose visceral (LV) nos últimos anos, associado à alta letalidade. É necessária a identificação de indicadores sensíveis e específicos que reconheçam precocemente a gravidade e possibilitem intervenção imediata e adequada. O objetivo do presente estudo prospectivo foi correlacionar parâmetros clínicos e laboratoriais e carga parasitária à evolução da LV em crianças. Foram incluídas 48 crianças com diagnóstico de LV, internadas no Hospital Infantil João Paulo II, em Belo Horizonte, de junho de 2010 a junho de 2011.Os pacientes foram avaliados clinicamente e tiveram amostras de sangue periférico coletadas antes (T0), entre 10 e 15 dias (T1) e entre 40 e 60 dias (T2) após início do tratamento. Nestas amostras, a carga parasitária foi quantificada por PCR quantitativa em tempo real (qPCR), sendo o gene alvo a SSU rRNA de Leishmania. Evolução grave foi definida como internação em UTI ou administração de amina vasoativa, ventilação mecânica ou hemotransfusão. As manifestações clínicas mais observadas à admissão foram febre, palidez e hepatosplenomegalia, associado à pancitopenia, elevação das aminotransferases hepáticas e hipoalbuminemia. Apositividade da RIFI e dos testes rápidos Kalazar Detect® e Diamed-IT Leish® foi de 66,7%, 85,4% e 100%, respectivamente.

Observou-se elevada positividade (100%)em exames de PCR convencional em sangue periférico e aspirado de medula óssea. Como tratamento específico, administrou-se Glucantime® em 45,8%,anfotericina B desoxicolato em 35,5%, anfotericina B lipossomal em 8,3% e associação de anfotericina B lipossomal e Glucantime® em 10,4% dos pacientes.Considerou-se que 56,2% das crianças apresentaram evolução grave, mas sem nenhum óbito. Em T2, todos apresentavam melhora clínica. A classificação por critérios de gravidade proposta pelo Ministério da Saúde em 2006 foi aplicada à admissão, não apresentando boa acurácia para detecção de casos com evolução grave. O qPCR apresentou bom desempenho e foi positivo em todas as crianças em T0. Observou-se variação ampla da carga parasitária em T0, não correlacionada a características clínicas e laboratoriais, a critérios de gravidade e escores preditores de óbito à admissão e à evolução grave durante a internação. Redução significativa do número de cópias do fragmento gênico foi constatada em T1 e T2, que não variou de acordo com a medicação usada. Identificaram-se como fatores de risco para evolução grave idade menor do que 12 meses, taquidispneia, infecção,hepatomegalia volumosa, anemia, plaquetopenia e hipoalbuminemia à admissão.

Evolução de parâmetros clínicos e da carga parasitária em sangue periférico de crianças hospitalizadas por leishmaniose visceral / Evolution of clinical parameters and load parasites in the peripheral blood of children hospitalized for visceral leishmaniasis

No Brasil, observa-se aumento dos casos de leishmaniose visceral (LV) nos últimos anos, associado à alta letalidade. É necessária a identificação de indicadores sensíveis e específicos que reconheçam precocemente a gravidade e possibilitem intervenção imediata e adequada. O objetivo do presente estudo prospectivo foi correlacionar parâmetros clínicos e laboratoriais e carga parasitária à evolução da LV em crianças. Foram incluídas 48 crianças com diagnóstico de LV, internadas no Hospital Infantil João Paulo II, em Belo Horizonte, de junho de 2010 a junho de 2011.Os pacientes foram avaliados clinicamente e tiveram amostras de sangue periférico coletadas antes (T0), entre 10 e 15 dias (T1) e entre 40 e 60 dias (T2) após início do tratamento. Nestas amostras, a carga parasitária foi quantificada por PCR quantitativa em tempo real (qPCR), sendo o gene alvo a SSU rRNA de Leishmania. Evolução grave foi definida como internação em UTI ou administração de amina vasoativa, ventilação mecânica ou hemotransfusão. As manifestações clínicas mais observadas à admissão foram febre, palidez e hepatosplenomegalia, associado à pancitopenia, elevação das aminotransferases hepáticas e hipoalbuminemia. Apositividade da RIFI e dos testes rápidos Kalazar Detect® e Diamed-IT Leish® foi de 66,7%, 85,4% e 100%, respectivamente...

Observou-se elevada positividade (100%)em exames de PCR convencional em sangue periférico e aspirado de medula óssea. Como tratamento específico, administrou-se Glucantime® em 45,8%,anfotericina B desoxicolato em 35,5%, anfotericina B lipossomal em 8,3% e associação de anfotericina B lipossomal e Glucantime® em 10,4% dos pacientes.Considerou-se que 56,2% das crianças apresentaram evolução grave, mas sem nenhum óbito. Em T2, todos apresentavam melhora clínica. A classificação por critérios de gravidade proposta pelo Ministério da Saúde em 2006 foi aplicada à admissão, não apresentando boa acurácia para detecção de casos com evolução grave. O qPCR apresentou bom desempenho e foi positivo em todas as crianças em T0. Observou-se variação ampla da carga parasitária em T0, não correlacionada a características clínicas e laboratoriais, a critérios de gravidade e escores preditores de óbito à admissão e à evolução grave durante a internação. Redução significativa do número de cópias do fragmento gênico foi constatada em T1 e T2, que não variou de acordo com a medicação usada. Identificaram-se como fatores de risco para evolução grave idade menor do que 12 meses, taquidispneia, infecção,hepatomegalia volumosa, anemia, plaquetopenia e hipoalbuminemia à admissão...

Detección de bacterias contaminantes en huevos para consumo en Medellín y su área Metropolitana / Detection of contaminant bacteria in eggs for consumption in Medellín and its Metropolitan area / Detecção de bactérias contaminantes em ovos para consumo em Medellín e sua área metropolitana

Objetivo: buscar Salmonella y otras bacterias contaminantes en huevos comerciales. Métodos: Se muestrearonaleatoriamente 38 graneros expendedores de huevos de Medellín y Área Metropolitana, a su vez se escogieron al azar 6 huevos por granero para un total de 228 huevos estudiados. A cada huevo se le extrajeron 4 muestras, para un total de 912 muestras que se dividieron en grupos. Cada grupo de muestras fue procesado para cultivobacteriano y PCR para Salmonella. Resultados: Se aislaron Bacillus sp; Pseudomonas sp, Enterobacter sp, Serratia sp., Citrobacter sp., E. coli, Streptococcus viridans, Klebsiella sp., Staphylococcus sp., Aeromonas sp., Sarcinas sp., Acinetobacter sp, E. hermanii, Proteus y Stenotrophomonas maltophilia. Todos los cultivos y PCR fueron negativos para Salmonella. Conclusiones: Es importante conocer qué bacterias están contaminando los huevos comerciales, algunas de ellas potencialmente patógenas para los humanos, especialmente para niños, inmunocomprometidos y ancianos, como Aeromonas sp, E. coli y S. aureus. Con los resultados obtenidos se puede concluir que durante los meses Junio-Noviembre de 2007, periodo en el cual se recogió la muestra para este estudio no se detectó Salmonella en huevos comerciales de la ciudad de Medellín y Área Metropolitana.

Objective. Search for Salmonella and other bacteria in commercial eggs. Methods. Thirty-eight neighborhood grocery stores in the city of Medellin and its Metropolitan area were chosen at random; also from each grocery store 6 eggs were selected randomly, for a total of 228 tested eggs. Four samples from every egg were taken, 912 samples in total,which were divided in groups. Every group of samples was cultured in bacteriological media and PCR for Salmonella was performed. Results. The bacterium isolated from the samples were: Bacillus sp., Pseudomonas sp., Enterobacter sp., Serratia sp., Citrobacter sp., E. coli, Streptococcus viridans, Klebsiella sp., Staphylococcus sp., Aeromonas sp., Sarcinas sp., Acinetobacter sp., E. hermanii, Proteus and Stenotrophomonas maltophilia. All cultures and PCR were negative for Salmonella. Conclusions. According to these results, the isolation of contaminating bacteria, such as Aeromonas sp, E. coli, and S. aureus, in commercial eggs is relevant since some of them are potentially pathogenic to humans, especially children, the immunocompromised and the elderly. We can conclude that from June to November 2007, the period during which the samples were taken for this current study, Salmonella was notdetected in commercial eggs in the city of Medellin and it’s Metropolitan Area.

Objetivo. Procurar Salmonella e outras bactérias em ovos comerciais. Métodos. Trinta e oito mercearias de bairroda cidade de Medellín e sua área metropolitana foram escolhidos aleatoriamente; também das mercearias, 6 ovos foram selecionados aleatoriamente, para um total de 228 ovos analisados. Quatro amostras de cada ovo foram tomadas, 912 amostras no total, que foram divididos em grupos. Cada grupo de amostras foi cultivada em meio bacteriológico e PCR para Salmonella foi realizada. Resultados. As bactérias isoladas das amostras foram: Bacillus sp.; Pseudomonas sp, Enterobacter sp, Serratia sp., Citrobacter sp., E. Coli, Streptococcus viridans, Klebsiella sp., Staphylococcus sp., Aeromonas sp., Sarcinas sp., Acinetobacter sp., E. Hermanji, Proteus e Stenotrophomonas maltophilia. Todas as culturas e o PCR foram negativas para Salmonella. Conclusões. É importante conhecer que as bactérias, como Aeromonas sp, E. coli e S. aureus, estão contaminando os ovos comerciais e alguns deles são potencialmente patogênicos para o homem, especialmente para crianças, imune-comprometidos e idosos. Com osresultados obtidos pode-se concluir que durante os meses de junho ao novembro de 2007, o período no qual foicolhidas as amostras pra o estudo atual, Salmonella não foi detectada em ovos comerciais na cidade de Medellín esua área metropolitana.